La coordination de la planification écologique est confiée au ​​Secrétariat général de la planification écologique (SGPE). Celui-ci a pour mission d’assurer la cohérence et le suivi des politiques à visée écologique, d’initier et de piloter la mobilisation des ministères et parties prenantes, de coordonner toutes les négociations et enfin de mesurer la performance des actions menées. Pour mener à bien ces missions, le SGPE dispose d’une équipe pluridisciplinaire aux expertises complémentaires : des ingénieurs, des experts des questions environnementales, financières et économiques, ainsi que des spécialistes de la mobilisation.